Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trpc1Q61056 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc1Q61056 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms