Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarb1Q61009 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scarb1Q61009 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Scarb1Q61009 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Scarb1Q61009 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb1Q61009 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms