Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rbbp4Q60972 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp4Q60972 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms