Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha1Q60750 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha1Q60750 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms