Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CttnQ60598 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CttnQ60598 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CttnQ60598 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms