Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tnfsf15Q5UBV8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms