Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl4Q5U4E0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl4Q5U4E0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms