Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scaf1Q5U4C3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms