Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme4Q5SSW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme4Q5SSW2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme4Q5SSW2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms