Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp18Q5SSI6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp18Q5SSI6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms