Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm6bQ5NCY0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm6bQ5NCY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm6bQ5NCY0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms