Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trim41Q5NCC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trim41Q5NCC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trim41Q5NCC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms