Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sdr39u1Q5M8N4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms