Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm2Q5FW85 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm2Q5FW85 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms