Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrc3Q5DU56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nlrc3Q5DU56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms