Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrig2Q52KR2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrig2Q52KR2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms