Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spire1Q52KF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms