Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhox3aQ4TU90 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhox3aQ4TU90 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms