Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Shank3Q4ACU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shank3Q4ACU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms