Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam220aQ3ZN08 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam220aQ3ZN08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam220aQ3ZN08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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