Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd5Q3V1H9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms