Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Dnah12Q3V0Q1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnah12Q3V0Q1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms