Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rimbp3Q3V0F0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rimbp3Q3V0F0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rimbp3Q3V0F0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rimbp3Q3V0F0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rimbp3Q3V0F0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rimbp3Q3V0F0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms