Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hipk4Q3V016 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hipk4Q3V016 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms