Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3UZV7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms