Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E330034G19RikQ3UWX6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms