Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScimpQ3UU41 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScimpQ3UU41 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms