Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6899Q3USS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6899Q3USS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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