Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rtl4Q3URY0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms