Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nhlrc4Q3UP44 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms