Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp30Q3UN04 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp30Q3UN04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms