Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Washc4Q3UMB9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Washc4Q3UMB9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms