Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc33Q3ULW6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc33Q3ULW6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms