Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc61Q3UJV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms