Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3b2Q3UJB0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b2Q3UJB0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms