Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf224Q3UIW8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms