Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph3aQ3UFY4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms