Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21748Q3UE70 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms