Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtpbp6Q3U6U5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtpbp6Q3U6U5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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