Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U595 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U595 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U595 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U595 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U595 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U595 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3U595 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3U595 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms