Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TraddQ3U0V2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TraddQ3U0V2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms