Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc9Q3U0M1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms