Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc17a7Q3TXX4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc17a7Q3TXX4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms