Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccndbp1Q3TVC7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms