Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdnep1Q3TP92 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdnep1Q3TP92 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms