Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XylbQ3TNA1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XylbQ3TNA1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms