Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms