Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc2cQ3TLH4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrc2cQ3TLH4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms