Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc13Q3TIR1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms