Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plekhf1Q3TB82 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plekhf1Q3TB82 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms